散熱交流風扇在運作的時候，主要是將電能轉換為機械能。主要是我們為散熱交流風扇供電的時候，它本身所擁有的風扇線圈有電流通過，根據安培右手定則我們知道，線圈的周圍會必然會產生磁場，而散熱交流風扇的扇葉內部附著充有磁性的橡膠磁鐵，從而導體產生的磁場跟固定磁場產生吸斥力，當吸斥力大于風扇的靜摩擦力時（風扇軸承的摩擦力，扇葉轉動的風阻力），風扇扇葉自然轉動。
散熱交流風扇散熱是通過冷風進行散熱的，而影響風冷散熱的因素主要是散熱系統所處的環境構造，當系統環境相對密封時，選擇散熱風扇時需考慮風扇的風壓情況，當風扇風壓不夠，風扇轉速會明顯受到影響，進而風量下降明顯，達不到散熱效果，所以外部風壓是影響風扇轉速的一個因素（增壓型散熱風扇可以克服）；還有一個比較明顯的因素是外部環境，如風沙、油膩、高低溫等環境，普通散熱風扇沒有做防護處理的話，惡劣環境對其轉速影響也是很明顯的。